L'Honduras gode di un clima tropicale, con variazioni a seconda dell'altitudine e delle regioni.

Le zone costiere, in particolare intorno alle Islas de la Bahía e al Mar dei Caraibi, offrono un clima caldo e umido tutto l'anno, ideale per godersi le spiagge e le immersioni. Le regioni interne e montuose, nei dintorni di Tegucigalpa, godono di temperature più miti.

La stagione secca, da novembre ad aprile, è in genere il periodo migliore per viaggiare. La stagione delle piogge, da maggio a ottobre, porta con sé acquazzoni più frequenti, ma anche una natura particolarmente rigogliosa.